黑山獨立，意味之前與她結盟的塞爾維亞亦同時成為獨立國家，可是有政治分析家擔心，於九十年代飽受內戰蹂躪的科索沃可能是下一個鬧分裂的地方。
黑山成歐盟一員 黑山總理久卡諾維奇表示獨立是不想被人口超過他們十倍的塞爾維亞支配。人口八百萬的塞爾維亞雖然沒有參與公投，卻將自動變成一個內陸獨立國，軍隊將因無海岸可守而大幅改組。公投結果亦會迫便塞爾維亞正視內部問題。
分析家指，黑山獨立對科索沃甚至整個巴爾幹半島都會帶來影響。黑山獨立意味塞爾維亞可能在年底由聯合國支持的談判中失去科索沃省份。雖然塞爾維亞希望科索沃不會走上獨立之路，但當地佔多數的阿爾巴尼亞人已有呼聲要求獨立。
前南斯拉夫聯邦在九○年代的腥風血雨中解體，黑山在公投前是唯一和塞爾維亞結盟的共和國。斯洛文尼亞、克羅地亞、波斯尼亞和馬其頓已先後脫離獨立。
由於貝爾格萊德未能在限期前向聯合國交出前波黑塞軍總司令姆拉迪奇，歐盟暫停和塞黑的加盟談判，黑山獨立將令該國加快成立歐盟一員。