對於趙建銘將以「關係人」遭檢方傳訊，台大醫院內部正在討論如何處置他，他若被收柙，可能是該院創建百年以來第一人。
台大醫院發言人林鶴雄表示，由於趙建銘尚未被收柙，目前討論其未來狀況，只是預設性立場，而凡以主治醫生職位聘進該院者，即為公務人員，適用「公務員懲戒法」，若有違反相關規定者，將有公務人員懲戒委員會處置。
行政院生署醫事處則稱，根據醫事法，醫生如有在業務上不正當行為，其醫生資格可能被剝奪，但買賣股票與病人看病之間並無直接關係，因此趙的醫生資格不會受到影響。
「做了錯事我們要管」 醫師公會亦關注此事，公會醫學倫理及紀律委員會主委洪政武說，趙建銘案可能會進入司法程序，若是移送，則由法律層面處理，若是沒有移送，則會召開倫理委員會進行討論，「趙建銘是醫生，是我們的小孩，當小孩做了錯事，我們要管，才合乎社會要求。」
洪政武強調，若趙的行為違反社會道德，足以影響醫界的形象，公會將會建議懲處，最嚴重將會取消其醫生證書。